Kurikulum pembelajaran yang digunakan di MBI Amanatul Ummah Pacet merangkum kurikulum nasional dan kurikulum internasional. Kurikulum nasional mengikuti Kemendikbud dan Kemenag sedangkan untuk kurikulum internasional distandarisasikan dengan kurikulum yang digunakan di Universitas Al Azhar (Kairo-Mesir). Terdapat dua bagian sekolah, yakni sekolah formal (mengikuti kurikulum nasional ) dan sekolah mu’adalah/diniyah (mengikuti kurikulum standarisasi Al-azhar Cairo Mesir).Sehingga Ijazah kelulusan yang didapatkan :
– Ijazah Nasional
– Ijazah Muadalah yang disetarakan dengan Al Azhar (Kairo-Mesir)
– Setifikat English Asessment Test (TOEFL/MECCA)
– Setifikat Arabic Asessment Test (TOAFL/MADINAH)
Setiap santri wajib mengikuti dua sekolah, yakni sekolah formal dan sekolah muadalah. Setiap kelas terdiri maksimal 27-30 santri (kelas dipisah antara putra dan putri). Meskipun dialog percakapan sehari-sehari santri diwajibkan menggunakan bahasa arab & inggris, akan tetapi pada pelajaran formal disampaikan dalam bahasa Indonesia dan ujian mata pelajaran umum (MIPA) diujikan dalam bahasa inggris. Setiap santri diwajibkan berbahasa Inggris dan Arab dalam kesehariannya. Wajib mengikuti ektrakulikuler pilihan. Para santri juga ada pembimbingan khusus untuk membaca kitab kuning (klasik) serta hafalan beberapa kita kuning.